iMeta讲坛 第26期肠道菌群的核心生态结构双群竞争模型TCG的发现及其临床意义肺炎克雷伯菌进化和传播趋势01报告人简介赵立平 教授上海交通大学 / 罗格斯大学赵立平美国新泽西州立罗格斯大学生物化学与微生物学系冠名讲席终身杰出教授上海交通大学生命科学技术学院微生物学特聘教授。2014年入选美国微生物科学院AAM。2016-2025担任加拿大高等研究院CIFAR fellow。2006-2012担任《国际微生物生态学会》常务理事。从2008年起担任《国际人类微生物组联盟IHMC执行委员会》委员。2004-2009担任《上海系统生物医学研究中心》常务副主任。2018-2024美国胃肠病学会AGA《微生物组研究与教育中心》科学顾问。从事肠道菌群与代谢健康研究三十余年发现首例可以引起肥胖的人体肠道病菌开发了以肠道菌群为靶点的肥胖症、糖尿病营养治疗方案建立了不依赖数据库的、基于生态功能群的微生物组数据分析技术平台建立了“两个竞争性功能群”构成的核心菌群模型。在Science、Cell、PNAS、ISME Journal、Nature Communications、Nature Reviews Microbiology等刊物发表论文百余篇。2012年美国《科学》周刊对他的研究工作做过专题报道。02报告简介肠道菌群研究虽取得重要进展但在向临床应用转化过程中仍然面临因果不清、机制不明和效果不稳的挑战。这在很大程度上源于样本采集和DNA提取过程中的质量控制不足以及以属或种为单位的低分辨率数据分析方法。我们将肠道菌群视为一个复杂适应系统Complex Adaptive System, CAS在基因组分辨率下识别在环境扰动中仍保持稳定生态关系的核心网络结构并发现其由两个相互竞争的功能群组成即双群竞争模型Two Competing Guilds, TCG。其中基石功能群Foundation Guild, FG通过产生乙酸和丁酸为宿主提供抗炎、维护肠屏障、调节肠道内分泌、节制食欲和促进脂肪分解代谢等功能而病生功能群Pathobiont Guild, PG则通过产生内毒素、吲哚和硫化氢等活性分子诱发炎症、引起胰岛素抵抗、扰乱肠道内分泌、造成暴食行为并促进脂肪积累。临床研究表明通过营养干预增强FG并抑制PG可以改善肥胖和糖尿病等代谢表型。基于这一结构框架我们提出以恢复基石功能群生态优势地位为目标的核心菌群疗法CoreGuild Therapy在伴随菌群失调的慢性疾病干预中具有良好的应用前景。03报告时间和链接报告时间2026年3月18日 星期三 14:30腾讯会议942-2844-8147会议链接https://meeting.tencent.com/dm/oHSBlNtSkx54会议密码315315注意事项腾讯会议室有100人限制人满请扫描下面二维码观看直播生信宝典视频号直播预约共同主办单位更多推荐▼ 点击跳转高引文章 ▸▸▸▸iMeta | 引用20000海普洛斯陈实富发布新版fastp更快更好地处理FASTQ数据高引文章 ▸▸▸▸iMeta | 兰大张东组使用PhyloSuite进行分子系统发育及系统发育树的统计分析高引文章▸▸▸▸iMeta | 唐海宝/张兴坦-用于比较基因组学分析的多功能分析套件JCVIiMeta封面1卷1期1卷2期1卷3期1卷4期2卷1期2卷2期2卷3期2卷4期3卷1期3卷2期3卷3期3卷4期3卷5期3卷6期4卷1期4卷2期4卷3期4卷4期4卷5期4卷6期iMetaOmics封面1卷1期1卷2期2卷1期2卷2期2卷3期2卷4期iMetaMed封面1卷1期1卷2期期刊简介“iMeta” 是由威立、宏科学和本领域数千名华人科学家合作出版的开放获取期刊主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授担任。目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。目标是发表前10%(IF 20)的高影响力论文。期刊特色包括中英双语图文、双语视频、可重复分析、图片打磨、60万用户的社交媒体宣传等。2022年2月正式创刊相继被Google Scholar、PubMed、SCIE、ESI、DOAJ、Scopus等数据库收录2025年6月影响因子33.2中科院分区生物学1区Top位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249)微生物学科2/163仅低于Nature Reviews学科研究类期刊全球第一中国大陆5/585“iMetaOmics” 是“iMeta” 子刊主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊欢迎投稿iMetaMed 是“iMeta” 子刊专注于医学、健康和生物技术领域目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊欢迎投稿iMeta主页http://www.imeta.science姊妹刊iMetaOmics主页http://www.imeta.science/imetaomics/出版社iMeta主页https://onlinelibrary.wiley.com/journal/2770596x出版社iMetaOmics主页https://onlinelibrary.wiley.com/journal/29969514出版社iMetaMed主页https://onlinelibrary.wiley.com/journal/3066988xiMeta投稿https://wiley.atyponrex.com/journal/IMT2iMetaOmics投稿https://wiley.atyponrex.com/journal/IMO2iMetaMed投稿https://wiley.atyponrex.com/submission/dashboard?siteNameIMM3邮箱officeimeta.science最全1000植物核基因组数据库IMP (点击图片直达)高颜值免费 SCI 在线绘图(点击图片直达)往期精品(点击图片直达文字对应教程)LinuxPythonR绘图NGS基础GEO高级生信自学生信书籍系列教程心得体会转录组经典宏基因组蛋白质组单细胞系列测序发展史免费在线画图色彩搭配图形排版图形解读ChIP-seqTCGAGSEAWGCNA海哥组学傻瓜系列文章写作CytoscapeExcelPPT机器学习公众号投稿联系陈同 chentong_biology163.com
iMeta 讲坛26 | 赵立平-肠道菌群的核心生态结构(3.18下午14:30)
iMeta讲坛 第26期肠道菌群的核心生态结构双群竞争模型TCG的发现及其临床意义肺炎克雷伯菌进化和传播趋势01报告人简介赵立平 教授上海交通大学 / 罗格斯大学赵立平美国新泽西州立罗格斯大学生物化学与微生物学系冠名讲席终身杰出教授上海交通大学生命科学技术学院微生物学特聘教授。2014年入选美国微生物科学院AAM。2016-2025担任加拿大高等研究院CIFAR fellow。2006-2012担任《国际微生物生态学会》常务理事。从2008年起担任《国际人类微生物组联盟IHMC执行委员会》委员。2004-2009担任《上海系统生物医学研究中心》常务副主任。2018-2024美国胃肠病学会AGA《微生物组研究与教育中心》科学顾问。从事肠道菌群与代谢健康研究三十余年发现首例可以引起肥胖的人体肠道病菌开发了以肠道菌群为靶点的肥胖症、糖尿病营养治疗方案建立了不依赖数据库的、基于生态功能群的微生物组数据分析技术平台建立了“两个竞争性功能群”构成的核心菌群模型。在Science、Cell、PNAS、ISME Journal、Nature Communications、Nature Reviews Microbiology等刊物发表论文百余篇。2012年美国《科学》周刊对他的研究工作做过专题报道。02报告简介肠道菌群研究虽取得重要进展但在向临床应用转化过程中仍然面临因果不清、机制不明和效果不稳的挑战。这在很大程度上源于样本采集和DNA提取过程中的质量控制不足以及以属或种为单位的低分辨率数据分析方法。我们将肠道菌群视为一个复杂适应系统Complex Adaptive System, CAS在基因组分辨率下识别在环境扰动中仍保持稳定生态关系的核心网络结构并发现其由两个相互竞争的功能群组成即双群竞争模型Two Competing Guilds, TCG。其中基石功能群Foundation Guild, FG通过产生乙酸和丁酸为宿主提供抗炎、维护肠屏障、调节肠道内分泌、节制食欲和促进脂肪分解代谢等功能而病生功能群Pathobiont Guild, PG则通过产生内毒素、吲哚和硫化氢等活性分子诱发炎症、引起胰岛素抵抗、扰乱肠道内分泌、造成暴食行为并促进脂肪积累。临床研究表明通过营养干预增强FG并抑制PG可以改善肥胖和糖尿病等代谢表型。基于这一结构框架我们提出以恢复基石功能群生态优势地位为目标的核心菌群疗法CoreGuild Therapy在伴随菌群失调的慢性疾病干预中具有良好的应用前景。03报告时间和链接报告时间2026年3月18日 星期三 14:30腾讯会议942-2844-8147会议链接https://meeting.tencent.com/dm/oHSBlNtSkx54会议密码315315注意事项腾讯会议室有100人限制人满请扫描下面二维码观看直播生信宝典视频号直播预约共同主办单位更多推荐▼ 点击跳转高引文章 ▸▸▸▸iMeta | 引用20000海普洛斯陈实富发布新版fastp更快更好地处理FASTQ数据高引文章 ▸▸▸▸iMeta | 兰大张东组使用PhyloSuite进行分子系统发育及系统发育树的统计分析高引文章▸▸▸▸iMeta | 唐海宝/张兴坦-用于比较基因组学分析的多功能分析套件JCVIiMeta封面1卷1期1卷2期1卷3期1卷4期2卷1期2卷2期2卷3期2卷4期3卷1期3卷2期3卷3期3卷4期3卷5期3卷6期4卷1期4卷2期4卷3期4卷4期4卷5期4卷6期iMetaOmics封面1卷1期1卷2期2卷1期2卷2期2卷3期2卷4期iMetaMed封面1卷1期1卷2期期刊简介“iMeta” 是由威立、宏科学和本领域数千名华人科学家合作出版的开放获取期刊主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授担任。目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。目标是发表前10%(IF 20)的高影响力论文。期刊特色包括中英双语图文、双语视频、可重复分析、图片打磨、60万用户的社交媒体宣传等。2022年2月正式创刊相继被Google Scholar、PubMed、SCIE、ESI、DOAJ、Scopus等数据库收录2025年6月影响因子33.2中科院分区生物学1区Top位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249)微生物学科2/163仅低于Nature Reviews学科研究类期刊全球第一中国大陆5/585“iMetaOmics” 是“iMeta” 子刊主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊欢迎投稿iMetaMed 是“iMeta” 子刊专注于医学、健康和生物技术领域目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊欢迎投稿iMeta主页http://www.imeta.science姊妹刊iMetaOmics主页http://www.imeta.science/imetaomics/出版社iMeta主页https://onlinelibrary.wiley.com/journal/2770596x出版社iMetaOmics主页https://onlinelibrary.wiley.com/journal/29969514出版社iMetaMed主页https://onlinelibrary.wiley.com/journal/3066988xiMeta投稿https://wiley.atyponrex.com/journal/IMT2iMetaOmics投稿https://wiley.atyponrex.com/journal/IMO2iMetaMed投稿https://wiley.atyponrex.com/submission/dashboard?siteNameIMM3邮箱officeimeta.science最全1000植物核基因组数据库IMP (点击图片直达)高颜值免费 SCI 在线绘图(点击图片直达)往期精品(点击图片直达文字对应教程)LinuxPythonR绘图NGS基础GEO高级生信自学生信书籍系列教程心得体会转录组经典宏基因组蛋白质组单细胞系列测序发展史免费在线画图色彩搭配图形排版图形解读ChIP-seqTCGAGSEAWGCNA海哥组学傻瓜系列文章写作CytoscapeExcelPPT机器学习公众号投稿联系陈同 chentong_biology163.com
