PyMOL小白安装教程PyMOL是一款基于Python语言的三维结构可视化软件。一、安装Python1、检查是否有python环境打开cmd输入python --version 或 py --version如果已经安装则会显示python的版本。如下图如果现象原因解决方案python 无反应py有效且出现版本号未添加到PATH使用py命令或手动添加 PATH两者都无反应或提示“py 不是内部或外部命令也不是可运行的程序或批处理文件。”Python 未安装重新安装 Python勾选 Add to PATH2、安装python如果出现上一步出现无反应或提示“py 不是内部或外部命令也不是可运行的程序或批处理文件。”则需要安装python。1下载python安装包网址https://www.python.org/downloads/windows/选择相应版本安装包下载即可。注意Python版本需要跟Pymol相对应如果不知道什么版本可以跳转到”二、Pymol安装”查看你需要安装的python版本。这里我下载的是3.14.3版本载完成后即可安装2安装python点击下载的.exe文件-右键-以管理员身份运行 勾选“use admin privileges when installing py.exe和”Add python.exe to PATH“;同时选择“Customize installation随后安装选项均为默认。直到出现安装位置。新建文件夹作为根目录自行定义命名但需要记住安装位置我的位置是D:\Program Files\Python\Python3点击Install将python安装在该目录下。等待几分钟即可。3检验安装情况打开cmd进入你python的安装路径我的是”D:\Program Files\Python\Python3“然后运行python --version 或 py --version出现版本号说明安装成功。二、PyMOL安装安装Pymol有两种来源一是官网版二是开源版1.官网版安装官网https://pymol.org/官网安装方便快捷按需要注册并提供相应费用。或者可以选择试用30天。30天后一般功能不受影响但渲染Ray会出现水印无法生成高质量的图片。注意Python与PyMOL的版本需要相互对应匹配2.开源版安装PyMOL开源版源代码托管在GitHub上如果直接从代码安装的话需要进行编译各种依赖较为复杂。所幸的是网上有一些已经编译好的作为python包的PyMOL可以直接安装这些包1下载pymol的wheel文件pymol-open-sorce-wheels是github上提供预编译好的PyMOL包的仓库从该项目的release页面https://github.com/cgohlke/pymol-open-source-wheels/releases中下载相关组件。注意下载的文件需要和安装的python版本相对应pymol-3.2.010-*pymol_launcher-3.0-*这里因为我下载的python版本是3.14版本的因此我下载的是pymol-3.2.0a0-cp314-cp314-win_amd64和pymol_launcher-3.0-cp314-cp314-win_amd642安装PyMOL安装依赖numpypip install -i https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/pypi/web/simple numpy由于我的电脑在之前就已经安装完numpy因此这里没有图示。下面的图是我参考的博客的图可以自行查看但人家安装的3.12版本。然后安装下载的pymol的wheel文件pip install pymol-3.2.0a0-cp314-cp314-win_amd64.whl最后安装pymol-launcher的wheel文件pip install pymol_launcher-3.0-cp314-cp314-win_amd64.whl到此Pymol安装完成最后可以在C:\Users\用户名\AppData\Roaming\Python\Python314\Scripts下找到pymol.exe可执行文件双击打开参考链接1.https://zhuanlan.zhihu.com/p/6284184292.(41 封私信) 最新PyMOL开源版本下载和安装 - 知乎
PyMOL小白安装教程
PyMOL小白安装教程PyMOL是一款基于Python语言的三维结构可视化软件。一、安装Python1、检查是否有python环境打开cmd输入python --version 或 py --version如果已经安装则会显示python的版本。如下图如果现象原因解决方案python 无反应py有效且出现版本号未添加到PATH使用py命令或手动添加 PATH两者都无反应或提示“py 不是内部或外部命令也不是可运行的程序或批处理文件。”Python 未安装重新安装 Python勾选 Add to PATH2、安装python如果出现上一步出现无反应或提示“py 不是内部或外部命令也不是可运行的程序或批处理文件。”则需要安装python。1下载python安装包网址https://www.python.org/downloads/windows/选择相应版本安装包下载即可。注意Python版本需要跟Pymol相对应如果不知道什么版本可以跳转到”二、Pymol安装”查看你需要安装的python版本。这里我下载的是3.14.3版本载完成后即可安装2安装python点击下载的.exe文件-右键-以管理员身份运行 勾选“use admin privileges when installing py.exe和”Add python.exe to PATH“;同时选择“Customize installation随后安装选项均为默认。直到出现安装位置。新建文件夹作为根目录自行定义命名但需要记住安装位置我的位置是D:\Program Files\Python\Python3点击Install将python安装在该目录下。等待几分钟即可。3检验安装情况打开cmd进入你python的安装路径我的是”D:\Program Files\Python\Python3“然后运行python --version 或 py --version出现版本号说明安装成功。二、PyMOL安装安装Pymol有两种来源一是官网版二是开源版1.官网版安装官网https://pymol.org/官网安装方便快捷按需要注册并提供相应费用。或者可以选择试用30天。30天后一般功能不受影响但渲染Ray会出现水印无法生成高质量的图片。注意Python与PyMOL的版本需要相互对应匹配2.开源版安装PyMOL开源版源代码托管在GitHub上如果直接从代码安装的话需要进行编译各种依赖较为复杂。所幸的是网上有一些已经编译好的作为python包的PyMOL可以直接安装这些包1下载pymol的wheel文件pymol-open-sorce-wheels是github上提供预编译好的PyMOL包的仓库从该项目的release页面https://github.com/cgohlke/pymol-open-source-wheels/releases中下载相关组件。注意下载的文件需要和安装的python版本相对应pymol-3.2.010-*pymol_launcher-3.0-*这里因为我下载的python版本是3.14版本的因此我下载的是pymol-3.2.0a0-cp314-cp314-win_amd64和pymol_launcher-3.0-cp314-cp314-win_amd642安装PyMOL安装依赖numpypip install -i https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/pypi/web/simple numpy由于我的电脑在之前就已经安装完numpy因此这里没有图示。下面的图是我参考的博客的图可以自行查看但人家安装的3.12版本。然后安装下载的pymol的wheel文件pip install pymol-3.2.0a0-cp314-cp314-win_amd64.whl最后安装pymol-launcher的wheel文件pip install pymol_launcher-3.0-cp314-cp314-win_amd64.whl到此Pymol安装完成最后可以在C:\Users\用户名\AppData\Roaming\Python\Python314\Scripts下找到pymol.exe可执行文件双击打开参考链接1.https://zhuanlan.zhihu.com/p/6284184292.(41 封私信) 最新PyMOL开源版本下载和安装 - 知乎
