一、HuProt™ 20K人类蛋白组芯片简介HuProt™ 20K人类蛋白组芯片又称人类蛋白质组微阵列是一种用于蛋白互作分析和小分子靶点筛选的高通量蛋白芯片技术。该芯片在表面固定超过20,000种高质量全长重组人源蛋白覆盖约81%的人类基因组ORF区域共包含16,794个独立的人类基因可用于发现小分子直接结合蛋白为药物作用机制研究提供候选靶点信息。二、HuProt™ 20K人类蛋白组芯片检测原理HuProt™ 20K人类蛋白组芯片基于小分子与蛋白之间的直接物理结合原理进行检测。实验过程中首先通过封闭液处理芯片降低非特异性吸附。随后将生物素标记的小分子探针与芯片共同孵育使其与固定蛋白发生结合。完成洗涤后加入Cy3/Cy5荧光标记链霉亲和素与探针上的生物素结合。最终通过检测芯片荧光信号强度分析小分子可能结合的直接靶点蛋白。三、HuProt™ 20K人类蛋白组芯片的主要优势1. 直接筛选结合靶点传统Pull-down等技术通常依赖细胞裂解液进行筛选容易检测到蛋白复合物中的间接结合蛋白。HuProt™ 20K人类蛋白组芯片中的蛋白以独立形式固定因此检测信号能够直接反映小分子与单个蛋白之间的物理互作有效减少细胞复杂环境造成的干扰。2. 提高低丰度靶点发现能力芯片蛋白采用真核酵母表达系统制备并经过纯化处理具有较好的蛋白活性和较高纯度。因此对于细胞内丰度较低、结合能力较弱或瞬时结合的蛋白也具有较好的检测能力可降低质谱筛选过程中靶点遗漏的风险。3. 完善的蛋白质量控制体系HuProt™ 20K人类蛋白组芯片采用真核酵母表达系统有利于保持蛋白天然构象。同时通过N端GST-His6双标签纯化技术富集正确折叠蛋白减少错误折叠蛋白影响。每个芯片区块均设置阳性参照和阴性参照每种蛋白设置两个技术重复点保证实验稳定性和重复性。四、实验样本及数据分析要求小分子样本要求进行HuProt™ 20K人类蛋白组芯片实验时推荐优先采用生物素标记的小分子。若化合物本身具有荧光也可尝试直接检测但需要注意背景信号问题建议提前进行预实验。此外小分子的溶解性能会影响检测效果通常建议使用DMSO溶解后再进行稀释例如稀释1000倍至10μM左右。候选靶点筛选方法芯片数据分析通常结合Z-Score和I-Mean Ratio两个指标。其中Z-Score用于判断蛋白是否与小分子发生结合I-Mean Ratio用于评价实验组与对照组之间的结合强度差异。此外还可以结合SNR、A6SD等算法并结合GO、KEGG功能分析筛选与研究方向相关的候选蛋白。五、候选靶点验证及应用价值HuProt™ 20K人类蛋白组芯片筛选获得的是体外候选靶点信息后续通常需要进一步验证。常用验证方法包括SPR分子动力学、CETSA、DARTS以及Pull-downWB等用于确认小分子与蛋白之间的直接结合关系。同时可结合基因敲除、基因敲低等实验验证候选靶点的生物学功能。六、HuProt™ 20K人类蛋白组芯片的科研应用一次HuProt™ 20K人类蛋白组芯片实验可以获得数十至数百个潜在靶点数据具有持续挖掘价值。由于芯片覆盖激酶、受体、转录因子等30余类蛋白因此同一份实验数据可支持不同疾病方向和信号通路研究。例如在熊果酸UA研究中同一份芯片数据分别围绕DCN和SPP1两个不同靶点于2021年和2024年发表了两篇高水平研究论文。此外HuProt™ 20K人类蛋白组芯片还可与转录组等多组学技术联合应用构建从“药物结合靶点”到“信号通路变化”再到“药效表型”的完整机制研究体系。目前该技术不仅用于小分子靶点筛选还可应用于蛋白质-蛋白质相互作用研究代谢物及多肽靶点筛选自身抗体谱筛选及Biomarker开发抗体特异性检测、疫苗开发及抗原鉴定。达吉特天然产物靶点发现技术、化合物靶点鉴定以及药物-蛋白相互作用研究服务推动药物机制研究不断深入目前已经助力研究成果频繁登上STTT、Mol Cancer、J. Hepatol、Gut、Exploration、Cell Mol Immunol、Circ Res、Nat Commun、Adv Sci、Cancer Commun、Theranostics、APSB、MedComm、Redox Biol、Clin Mol Hepatol、PNAS等国际学术期刊。达吉特20K人类蛋白组芯片靶点筛选实验客户服务案例Chen YJ, Shi RC, Xiang YC, et al. Malate initiates a proton-sensing pathway essential for pH regulation of inflammation.Signal Transduct Target Ther.2024;9(1):367. Published 2024 Dec 30. doi:10.1038/s41392-024-02076-9(陆军军医大学附属第一医院)IF40.8Hu M, Xu Y, Wang Y, et al. Gut microbial-derived N-acetylmuramic acid alleviates colorectal cancer via the AKT1 pathway.Gut.Published online February 27, 2025. doi:10.1136/gutjnl-2024-332891(南方医科大学珠江医院)IF23.1Shao M, Zhang X, Sun J, et al. Saikosaponin b1 Attenuates Liver Fibrosis by Blocking STAT3/Gli1 Interaction and Inducing Gli1 Degradation.Exploration.2766-8509.(浙江中医药大学)IF22.5Xu Q, Li G, Zhang H, et al. The natural flavonoid dihydromyricetin targets senescent cells via PRDX2 and alleviates age-related diseases.Nat Commun.Published online March 6, 2026. doi:10.1038/s41467-026-70302-9(上海交通大学医学院)IF15.7Chen L, Wu B, Mo L, et al. High-content screening identifies ganoderic acid A as a senotherapeutic to prevent cellular senescence and extend healthspan in preclinical models.Nat Commun.2025;16(1):2878. Published 2025 Mar 24. doi:10.1038/s41467-025-58188-5(华中科技大学同济医学院)IF15.7Gu Y, Chen Y, Wei L, et al. Author Correction: ABHD5 inhibits YAP-induced c-Met overexpression and colon cancer cell stemness via suppressing YAP methylation.Nat Commun.2023;14(1):1875. Published 2023 Apr 4. doi:10.1038/s41467-023-37521-w(第三军医大学) IF15.7Zhong J, He X, Gao X, et al. Hyodeoxycholic acid ameliorates nonalcoholic fatty liver disease by inhibiting RAN-mediated PPARα nucleus-cytoplasm shuttling.Nat Commun.2023;14(1):5451. Published 2023 Sep 6. doi:10.1038/s41467-023-41061-8(上海中医药大学)IF15.7Shen SM, Ji Y, Zhang C, et al. Nuclear PTEN safeguards pre-mRNA splicing to link Golgi apparatus for its tumor suppressive role.Nat Commun.2018;9(1):2392. Published 2018 Jun 19. doi:10.1038/s41467-018-04760-1(上海交通大学)IF15.7Li D, Wei R, Zhang X, et al. Gut commensal metabolite rhamnose promotes macrophages phagocytosis by activating SLC12A4 and protects against sepsis in mice.Acta Pharm Sin B.2024;14(7):3068-3085. doi:10.1016/j.apsb.2024.03.025(南方医科大学) IF14.6Xu X, Yan Y, Zheng M, et al. Emodin Alleviates Sepsis-Induced Multiorgan Damage by Inhibiting NETosis through Targeting Neutrophils BCL-10.Adv Sci (Weinh).2025 Aug 8:e17129.(首都医科大学附属北京中医医院)IF14.1Xuan C, Chen D, Zhang S, et al. Isoquercitrin Alleviates Diabetic Nephropathy by Inhibiting STAT3 Phosphorylation and Dimerization.Adv Sci (Weinh).Published online April 4, 2025. doi:10.1002/advs.202414587(中国人民解放军总医院) IF14.1Cui J, Chen Y, Yang Q, et al. Protosappanin A Protects DOX-Induced Myocardial Injury and Cardiac Dysfunction by Targeting ACSL4/FTH1 Axis-Dependent Ferroptosis.Adv Sci (Weinh).2024;11(34):e2310227. doi:10.1002/advs.202310227(哈尔滨医科大学附属第二医院)IF14.1Zheng Y, Zhao L, Xiong Z, et al. Ursolic acid targets secreted phosphoprotein 1 to regulate Th17 cells against metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease.Clin Mol Hepatol.2024;30(3):449-467. doi:10.3350/cmh.2024.0047(上海中医药大学联合广州中医药大学) IF14Zhou WJ, Yang HL, Mei J, et al. Fructose-1,6-bisphosphate prevents pregnancy loss by inducing decidual COX-2 macrophage differentiation.Sci Adv.2022;8(8):eabj2488. doi:10.1126/sciadv.abj2488(复旦大学附属妇产科医院)IF12.5Zhao T, Zeng J, Xu Y, et al. Chitinase-3 like-protein-1 promotes glioma progression via the NF-κB signaling pathway and tumor microenvironment reprogramming.Theranostics.2022;12(16):6989-7008. Published 2022 Oct 3. doi:10.7150/thno.75069(广州医科大学) IF12.4Chen L, Liu DH, Li YX, et al. Akebia Saponin D Targeting Ubiquitin Carboxyl-Terminal Hydrolase 4 Promotes Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma Deubiquitination and Activation of Brown Adipose Tissue Thermogenesis in Obesity.MedComm (2020).2025;6(11):e70420. Published 2025 Oct 15. doi:10.1002/mco2.70420(中日友好医院) IF10.7Deng Y, Zeng L, Liu H, et al. Silibinin attenuates ferroptosis in acute kidney injury by targeting FTH1.Redox Biol.2024;77:103360. doi:10.1016/j.redox.2024.103360(南方医科大学)IF10.7Wang G, Li X, Li N, et al. Icariin alleviates uveitis by targeting peroxiredoxin 3 to modulate retinal microglia M1/M2 phenotypic polarization.Redox Biol.2022;52:102297. doi:10.1016/j.redox.2022.102297(重庆医科大学附属第一医院)IF10.7Cheng Y, Wang G, Yang X, et al. Artesunate alleviates Parkinsons disease by targeting astrocyte MT2A to attenuate dopamine neuronal cuproptosis.Pharmacol Res.Published online August 1, 2025. doi:10.1016/j.phrs.2025.107895(遵义医科大学) IF10.5
HuProt™ 20K人类蛋白组芯片技术介绍
一、HuProt™ 20K人类蛋白组芯片简介HuProt™ 20K人类蛋白组芯片又称人类蛋白质组微阵列是一种用于蛋白互作分析和小分子靶点筛选的高通量蛋白芯片技术。该芯片在表面固定超过20,000种高质量全长重组人源蛋白覆盖约81%的人类基因组ORF区域共包含16,794个独立的人类基因可用于发现小分子直接结合蛋白为药物作用机制研究提供候选靶点信息。二、HuProt™ 20K人类蛋白组芯片检测原理HuProt™ 20K人类蛋白组芯片基于小分子与蛋白之间的直接物理结合原理进行检测。实验过程中首先通过封闭液处理芯片降低非特异性吸附。随后将生物素标记的小分子探针与芯片共同孵育使其与固定蛋白发生结合。完成洗涤后加入Cy3/Cy5荧光标记链霉亲和素与探针上的生物素结合。最终通过检测芯片荧光信号强度分析小分子可能结合的直接靶点蛋白。三、HuProt™ 20K人类蛋白组芯片的主要优势1. 直接筛选结合靶点传统Pull-down等技术通常依赖细胞裂解液进行筛选容易检测到蛋白复合物中的间接结合蛋白。HuProt™ 20K人类蛋白组芯片中的蛋白以独立形式固定因此检测信号能够直接反映小分子与单个蛋白之间的物理互作有效减少细胞复杂环境造成的干扰。2. 提高低丰度靶点发现能力芯片蛋白采用真核酵母表达系统制备并经过纯化处理具有较好的蛋白活性和较高纯度。因此对于细胞内丰度较低、结合能力较弱或瞬时结合的蛋白也具有较好的检测能力可降低质谱筛选过程中靶点遗漏的风险。3. 完善的蛋白质量控制体系HuProt™ 20K人类蛋白组芯片采用真核酵母表达系统有利于保持蛋白天然构象。同时通过N端GST-His6双标签纯化技术富集正确折叠蛋白减少错误折叠蛋白影响。每个芯片区块均设置阳性参照和阴性参照每种蛋白设置两个技术重复点保证实验稳定性和重复性。四、实验样本及数据分析要求小分子样本要求进行HuProt™ 20K人类蛋白组芯片实验时推荐优先采用生物素标记的小分子。若化合物本身具有荧光也可尝试直接检测但需要注意背景信号问题建议提前进行预实验。此外小分子的溶解性能会影响检测效果通常建议使用DMSO溶解后再进行稀释例如稀释1000倍至10μM左右。候选靶点筛选方法芯片数据分析通常结合Z-Score和I-Mean Ratio两个指标。其中Z-Score用于判断蛋白是否与小分子发生结合I-Mean Ratio用于评价实验组与对照组之间的结合强度差异。此外还可以结合SNR、A6SD等算法并结合GO、KEGG功能分析筛选与研究方向相关的候选蛋白。五、候选靶点验证及应用价值HuProt™ 20K人类蛋白组芯片筛选获得的是体外候选靶点信息后续通常需要进一步验证。常用验证方法包括SPR分子动力学、CETSA、DARTS以及Pull-downWB等用于确认小分子与蛋白之间的直接结合关系。同时可结合基因敲除、基因敲低等实验验证候选靶点的生物学功能。六、HuProt™ 20K人类蛋白组芯片的科研应用一次HuProt™ 20K人类蛋白组芯片实验可以获得数十至数百个潜在靶点数据具有持续挖掘价值。由于芯片覆盖激酶、受体、转录因子等30余类蛋白因此同一份实验数据可支持不同疾病方向和信号通路研究。例如在熊果酸UA研究中同一份芯片数据分别围绕DCN和SPP1两个不同靶点于2021年和2024年发表了两篇高水平研究论文。此外HuProt™ 20K人类蛋白组芯片还可与转录组等多组学技术联合应用构建从“药物结合靶点”到“信号通路变化”再到“药效表型”的完整机制研究体系。目前该技术不仅用于小分子靶点筛选还可应用于蛋白质-蛋白质相互作用研究代谢物及多肽靶点筛选自身抗体谱筛选及Biomarker开发抗体特异性检测、疫苗开发及抗原鉴定。达吉特天然产物靶点发现技术、化合物靶点鉴定以及药物-蛋白相互作用研究服务推动药物机制研究不断深入目前已经助力研究成果频繁登上STTT、Mol Cancer、J. Hepatol、Gut、Exploration、Cell Mol Immunol、Circ Res、Nat Commun、Adv Sci、Cancer Commun、Theranostics、APSB、MedComm、Redox Biol、Clin Mol Hepatol、PNAS等国际学术期刊。达吉特20K人类蛋白组芯片靶点筛选实验客户服务案例Chen YJ, Shi RC, Xiang YC, et al. Malate initiates a proton-sensing pathway essential for pH regulation of inflammation.Signal Transduct Target Ther.2024;9(1):367. Published 2024 Dec 30. doi:10.1038/s41392-024-02076-9(陆军军医大学附属第一医院)IF40.8Hu M, Xu Y, Wang Y, et al. Gut microbial-derived N-acetylmuramic acid alleviates colorectal cancer via the AKT1 pathway.Gut.Published online February 27, 2025. doi:10.1136/gutjnl-2024-332891(南方医科大学珠江医院)IF23.1Shao M, Zhang X, Sun J, et al. Saikosaponin b1 Attenuates Liver Fibrosis by Blocking STAT3/Gli1 Interaction and Inducing Gli1 Degradation.Exploration.2766-8509.(浙江中医药大学)IF22.5Xu Q, Li G, Zhang H, et al. The natural flavonoid dihydromyricetin targets senescent cells via PRDX2 and alleviates age-related diseases.Nat Commun.Published online March 6, 2026. doi:10.1038/s41467-026-70302-9(上海交通大学医学院)IF15.7Chen L, Wu B, Mo L, et al. High-content screening identifies ganoderic acid A as a senotherapeutic to prevent cellular senescence and extend healthspan in preclinical models.Nat Commun.2025;16(1):2878. Published 2025 Mar 24. doi:10.1038/s41467-025-58188-5(华中科技大学同济医学院)IF15.7Gu Y, Chen Y, Wei L, et al. Author Correction: ABHD5 inhibits YAP-induced c-Met overexpression and colon cancer cell stemness via suppressing YAP methylation.Nat Commun.2023;14(1):1875. Published 2023 Apr 4. doi:10.1038/s41467-023-37521-w(第三军医大学) IF15.7Zhong J, He X, Gao X, et al. Hyodeoxycholic acid ameliorates nonalcoholic fatty liver disease by inhibiting RAN-mediated PPARα nucleus-cytoplasm shuttling.Nat Commun.2023;14(1):5451. Published 2023 Sep 6. doi:10.1038/s41467-023-41061-8(上海中医药大学)IF15.7Shen SM, Ji Y, Zhang C, et al. Nuclear PTEN safeguards pre-mRNA splicing to link Golgi apparatus for its tumor suppressive role.Nat Commun.2018;9(1):2392. Published 2018 Jun 19. doi:10.1038/s41467-018-04760-1(上海交通大学)IF15.7Li D, Wei R, Zhang X, et al. Gut commensal metabolite rhamnose promotes macrophages phagocytosis by activating SLC12A4 and protects against sepsis in mice.Acta Pharm Sin B.2024;14(7):3068-3085. doi:10.1016/j.apsb.2024.03.025(南方医科大学) IF14.6Xu X, Yan Y, Zheng M, et al. Emodin Alleviates Sepsis-Induced Multiorgan Damage by Inhibiting NETosis through Targeting Neutrophils BCL-10.Adv Sci (Weinh).2025 Aug 8:e17129.(首都医科大学附属北京中医医院)IF14.1Xuan C, Chen D, Zhang S, et al. Isoquercitrin Alleviates Diabetic Nephropathy by Inhibiting STAT3 Phosphorylation and Dimerization.Adv Sci (Weinh).Published online April 4, 2025. doi:10.1002/advs.202414587(中国人民解放军总医院) IF14.1Cui J, Chen Y, Yang Q, et al. Protosappanin A Protects DOX-Induced Myocardial Injury and Cardiac Dysfunction by Targeting ACSL4/FTH1 Axis-Dependent Ferroptosis.Adv Sci (Weinh).2024;11(34):e2310227. doi:10.1002/advs.202310227(哈尔滨医科大学附属第二医院)IF14.1Zheng Y, Zhao L, Xiong Z, et al. Ursolic acid targets secreted phosphoprotein 1 to regulate Th17 cells against metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease.Clin Mol Hepatol.2024;30(3):449-467. doi:10.3350/cmh.2024.0047(上海中医药大学联合广州中医药大学) IF14Zhou WJ, Yang HL, Mei J, et al. Fructose-1,6-bisphosphate prevents pregnancy loss by inducing decidual COX-2 macrophage differentiation.Sci Adv.2022;8(8):eabj2488. doi:10.1126/sciadv.abj2488(复旦大学附属妇产科医院)IF12.5Zhao T, Zeng J, Xu Y, et al. Chitinase-3 like-protein-1 promotes glioma progression via the NF-κB signaling pathway and tumor microenvironment reprogramming.Theranostics.2022;12(16):6989-7008. Published 2022 Oct 3. doi:10.7150/thno.75069(广州医科大学) IF12.4Chen L, Liu DH, Li YX, et al. Akebia Saponin D Targeting Ubiquitin Carboxyl-Terminal Hydrolase 4 Promotes Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma Deubiquitination and Activation of Brown Adipose Tissue Thermogenesis in Obesity.MedComm (2020).2025;6(11):e70420. Published 2025 Oct 15. doi:10.1002/mco2.70420(中日友好医院) IF10.7Deng Y, Zeng L, Liu H, et al. Silibinin attenuates ferroptosis in acute kidney injury by targeting FTH1.Redox Biol.2024;77:103360. doi:10.1016/j.redox.2024.103360(南方医科大学)IF10.7Wang G, Li X, Li N, et al. Icariin alleviates uveitis by targeting peroxiredoxin 3 to modulate retinal microglia M1/M2 phenotypic polarization.Redox Biol.2022;52:102297. doi:10.1016/j.redox.2022.102297(重庆医科大学附属第一医院)IF10.7Cheng Y, Wang G, Yang X, et al. Artesunate alleviates Parkinsons disease by targeting astrocyte MT2A to attenuate dopamine neuronal cuproptosis.Pharmacol Res.Published online August 1, 2025. doi:10.1016/j.phrs.2025.107895(遵义医科大学) IF10.5
